正山小种属于红茶，红茶自然也就有属于它独特的制作工艺，其中内里含有的一些成分是会有变化的。那么红茶在制作中，从萎凋到发酵，最先将鲜叶中的茶多酚酶促氧化为茶黄素，茶黄素氧化聚合为茶红素，茶红素再氧化聚合为茶褐素，具体的生化过程要复杂的多。
而在正山小种成品中，有一些物质是非常重要的，它对于茶汤的颜色也起着重要决定作用。那么红茶的汤色基本由三种物质主导，一是茶黄素，主导汤色亮度；二是茶红素，是茶汤主体色；是茶褐素，主导汤色深浅。
这里重点提一下茶褐素，为什么呢？因为这个物质就是跟我们存在的疑问是有关系的。红茶中茶褐素一般起到的是负面作用，造成茶汤发暗，缺乏刺激性。而发酵过度，以及缺氧发酵的结果。
对于普洱茶，大家也都是非常熟悉的，也是大众爱喝的一款茶叶，而茶褐素跟普洱茶也是大有联系。茶褐素却是普洱茶的关键成分，它造成了普洱茶茶汤红褐或黑褐，使其缺乏收敛性，并提供了甜醇的味道。
所以，总得来说，不管是正山小种，还是普洱茶，茶汤色发黑，首先断定茶褐素过多所致，因为茶褐素是影响茶品质的负因子。
当然，茶褐素这个因子肯定是首先考虑的一个原因，也不乏还有其它的原因。如果是放了几个小时，不排除温度下降会导致冷后浑现象，也就是茶黄素与咖啡因结合的产物。但结合汤色发黑这一情况，说明两者含量少，浑的可能性小，第二次断定茶褐素主导所致。
另外结合正山小种的制作工艺来看，存在过红锅和熏焙序的工序。而经过这两道工序的正山小种，茶褐素成分含量高也是正常的。总的来说，正山小种茶汤放置几小时后变成浅黑色，仍然是茶褐素在起作用。
